同一樣本可以多次做原位雜交實驗嗎?
一般情況下，如果操作沒有得到理想的結果，是可以將探針洗滌然后進行再次的雜交的。如果使用的是直標型探針，還可以使用不同探針對同一樣本進行反復雜交。針對不同的樣本，處理方法略有不同。
原位雜交實操中哪些因素比較重要?
重要的因素：溫度、光照、濕度和試劑的PH值。溫度和濕度直接影響著探針和目標DNA的雜交效率；光照影響著熒光染料的強度，所以探針要避光保存，其已經雜交的片子可用防熒光淬火劑封片且避光保存；各種試劑pH也要達到要求，這也直接關系到原位雜交的穩定性。
植物原位雜交在遺傳育種方面的應用主要包括：
異源染色質及多種染色體畸變檢測：通過遠緣雜交把有用遺傳物質基因的異源染色質漸滲到植物中。如帶有幾種抗病基因的黑麥1R染色體已被整合到許多高產的小麥品種中。原位雜交技術則是鑒定外源染色體(質)的有效手段。
基因組印記研究：基因組印記是指一個基因的兩條染色體上的DNA序列存在差異。通過植物原位雜交技術，可以檢測到基因組印記的存在和分布，從而幫助確定基因組的進化、遺傳和功能特征。
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